La baie de Seine, la baie des Veys, le golfe normand breton, les marais du Cotentin et du Bessin, le marais Vernier et les estuaires sont des sites majeurs pour la migration, la nidification et l’hivernage des oiseaux terrestres et marins.
Les mammifères marins (phoques gris et veaux marins, grands dauphins et marsouins communs) trouvent dans cette région des zones de repos, d’alimentation et de reproduction.
Les nombreux fleuves normands sont des espaces de reproduction et de croissance fréquentés par les poissons migrateurs tels que les salmonidés, les lamproies, les aloses ou les anguillidés.
La Normandie présente aussi des réservoirs d’espèces à enjeux (écrevisse à pieds blancs, mulette, azuré des mouillères, grand corbeau,…) sur des zones peu exposées aux pressions ou peu connectées aux grands bassins hydrographiques.
C’est le cas des coteaux calcaires, pelouses calcicoles, tourbières, landes, prés salés et falaises qui sont aussi associés à une flore rare. Les zones bocagères normandes et les milieux aquatiques associés constituent également des réservoirs de biodiversité remarquables.